Objawy choroby Leśniowskiego-Croha zależą od umiejscowienia zmian zapalnych. W przypadku najczęstszej lokalizacji, czyli w jelicie czczym, najczęściej występującymi objawami choroby Leśniowskiego-Croha są bóle brzucha, często w jego dolnej prawej części, biegunka, krwiste stolce, brak łaknienia, gorączka, spadek masy ciała.